您的宅基地被侄子先借住后霸占，这属于宅基地使用权纠纷。解决此类纠纷，应通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式。
以下是不同情况下的详细解释：
1. 如果您持有合法有效的宅基地使用权证书，且能证明侄子最初是借住，那么您对该宅基地拥有合法使用权，侄子的霸占行为是违法的。您有权要求其返还宅基地。
2. 若您没有宅基地使用权证书，但有土地登记资料、村委会证明等其他能证明您对该宅基地享有合法使用权的证据，且侄子的霸占行为没有合法依据，您同样有权通过法律途径主张权利。
3. 如果存在您与侄子之间就宅基地使用有书面或口头协议，且协议中明确了借住期限或条件，而侄子违反协议霸占宅基地，您可以依据协议内容要求其履行协议或承担违约责任。
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在处理您的宅基地被侄子先借住后霸占的问题时，以下特殊情况或例外情形可能会对处理结果造成影响：
1. 存在历史遗留问题： 如果该宅基地的权属在历史上就存在争议，例如在过去的土地改革、划分等过程中，宅基地的归属没有明确的书面记载或存在模糊不清的情况，可能需要考虑历史使用情况来综合判断。这种情况下，处理起来会比较复杂，需要收集更多关于历史使用的证据，如老一辈的证人证言、历史上的使用记录等，政府部门或法院在处理时也会更加谨慎，可能会延长处理时间或需要更充分的论证。
2. 政府规划调整： 如果该宅基地所在区域被纳入政府规划调整范围，如涉及拆迁、征收、新农村建设等，可能会导致宅基地权属发生变更。例如，政府规划将该区域的宅基地统一征收后重新分配，此时您对原宅基地的使用权可能会受到影响，需要按照政府的规划政策来处理，您与侄子的纠纷解决也可能需要与政府的规划调整工作相结合，处理方式和结果会受到规划政策的制约。
3. 侄子对宅基地进行了重大添附： 如果侄子在借住期间，未经您同意或在您不知情的情况下，对宅基地上的房屋进行了大规模的翻建、扩建或新建，投入了大量的资金和人力。这种情况下，在处理宅基地返还问题时，可能需要对侄子的添附价值进行评估和处理，是由您给予侄子适当的补偿后收回宅基地，还是如何处理，会增加纠纷解决的复杂性和成本。

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